科技合作基地設主任1名，常務副主任1名，副主任2名，基地實行主任負責制，主任負責基地的全面工作。常務副主任負責基地的日程管理工作；設立一名專職秘書，協助做好基地的日常管理工作。

為了切實有效地實施科技合作基地的主任負責制，保證各項重大決策的科學化、民主化和規(guī)范化，特設立主任負責制下的基地委員會，基委會人員由基地主任、副主任及主要學術帶頭人和學術骨干組成?；氐闹卮笫马椩趯嵤┣绊毺峤换瘯懻摏Q定。基地每3個月召開1次基委會會議，會上討論決定基地的重大事項（如人才引進與培養(yǎng)、大型儀器設備購置、合作申請重大項目、規(guī)章制度的制定或修改、財務計劃、實驗室維護改造等）?？萍己献骰厝粘９芾韺嵭谢?、研究室和課題組三級管理體制。

科技合作基地現有四個研究團隊，包括柴利教授牽頭的人工智能與信息融合研究團隊，常曉恒教授牽頭的故障診斷與模糊控制研究團隊，伍世虔教授牽頭的機器視覺與智能系統(tǒng)研究團隊，李曉卉教授牽頭的電力系統(tǒng)與微電子器件研究團隊。科技合作基地與包括加拿大、美國、澳大利亞、韓國、新加坡、日本等國家高校保持緊密的國際科研合作關系。